发布时间:2017-08-08

济南市

2017-08

功能基因组、长非编码RNA、表观遗传学培训班

会议时间: 2017-08-182017-08-21结束

会议地点: 山东大学计算中心 查看地图

会议主办方: 中国科学院计算技术研究所 烟台分所

联系人: 张爱国

联系电话: 13683111214,010-58032788

电子邮箱: 1256090094@qq.com

会议通知

  本期培训班有着丰富的内容,前沿科研技术,培训班中包括了非编码RNA的功能研究策略与科研设计,研究关键技术等,涵盖长链非编码RNA、小分子RNA与表观遗传学的完整解决方案,理论讲解和实验操作结合,让你更快更好地掌握时下科研技术与科研方向。

  培训内容:

  一、DNA测序技术-原理及技术

  a)第二代测序技术:Illumina,454, Ion Torrent原理

  b)第三代测序技术:PacBio, Hellicos原理

  c)第四代测序技术:Oxford NanoPore原理

  d)Hybridization based methods

  e)测序技术的比较及展望

  二、基因组编辑技术(CRIPR技术)

  a)不同基因组编辑技术的比较Meganuclease,ZFN,TALEN,

  b)CRISPR-Cas9

  c)CRISPR-Cas系统的作用机理

  d)CRISPR-Cas系统在基因组编辑中的应用

  e)CRISPR-Cas系统的其他应用

  三、生物信息学基本实验技能

  a)Linux常用命令

  b)EMBOSS,经典序列分析工具集

  c)Perl编程基础

  四、小RNA(microRNA)研究方法及案例

  a)实验流程

  b)数据处理比对

  c)靶基因富集分析

  d )miRNA-mRNA关联分析

  e)主要工具包的使用:miRDeep,mirDeep*

  五、长非编码RNA(lncRNA)研究方法及案例

  a)实验流程

  b)lncRNA的发现和分类

  c) 功能分类

  d)主要工具包的使用:lncRScan,LncRNAFunction等

  六、表观遗传学研究方法及案例

  a )DNA methylation, MeDIP-seq

  b )Histone modifications, ChIP-seq, ChIP-exo

  c )Nucleosoem positioning and occupancy, MNase-seq

  d )Chromatin accessibility, DNase-seq

  e )3D chromatin structure, 3C, 4C, 5C, Hi-C

  七、基于DNA/RNA测序技术的功能基因组学研究策略分析

  a )ARNA Transcription: ChIRP-Seq, GRO-Seq, Ribo-Seq, CLIP-Seq

  b )RNA structure: SHAPE-Seq, PARS-Seq, FRAG-Seq, CAP-seq

  c )Low-level RNA detection: Quartz-Seq, DP-Seq, Smart-Seq, d

  d )Smart-Seq2

  e )Low-level DNA detection: smMIP, MDA, MALBAC, OS-Seq

  非编码RNA和表观遗传学是近年来生命科学领域的研究热点,非编码RNA在包括发育、免疫、生殖等基本生理过程中扮演了不可替代的角色,同时在包括多种重大疾病中也发挥重要作用。2016年,表观转录组分析(Epitranscriptome analysis)荣膺Nature Methods年度生命科学技术,目前已知的RNA修饰超过100种,其中很多修饰能参与到真核基因表达调控。非编码RNA和RNA表观遗传学的研究,将加深人类对生命系统复杂调控网的理解和认识,并为疾病的研究和治疗提供新的视角,有望从中发现新的分子标志物与治疗靶点。

  报名须知:

  1.注册费:4300元/人;(包括培训费、资料费、上机费、考试费等;食宿统一安排,费用自理)

  2.团体优惠:同一单位5位学员参加,可额外赠送1个免费名额;

  3.本次培训班共35个名额,培训座位按收到报名表先后顺序安排。

  主办单位:中国科学院计算技术研究所 烟台分所

  培训地点:山东大学 计算中心

  培训时间:2017.8.18——8.21

  联系人:张爱国

  联系电话:13683111214

  咨询电话:010-58032788

  邮箱:1256090094@qq.com


乘车路线 山东大学计算中心

  从济南站出发:在火车站上车乘brt5路至洪家楼站下车,步行370米到达山东大学(洪家楼校区)。约54分钟。打车8.4公里,约27分钟,约19元。

  从济南西站出发:在长途汽车西站上车乘K910路至二环东路花园路站下车,步行370米到达山东大学(洪家楼校区),约1小时31分钟。打车19.7公里,约40分钟,约45元。


公交/驾车去这里

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