发布时间:2016-08-29

杭州市

2016-09

浙江大学基因组科学研习班

会议时间: 2016-09-232016-09-30结束

会议地点: 浙江大学华家池校区 查看地图

会议主办方: 浙江大学

联系人: 代成林,沈志成

联系电话: 18757558672,13958194424

电子邮箱: daichenglin@zju.edu.cn

会议通知

  随着众多生物基因组测序项目的完成,生物学数据正在加速度增长。如何科学地分析和注释这些高通量数据,已成为生物学工作者急需学习和解决的问题。

  浙江大学“基因组科学”研习班邀请北京基因组所于军教授、胡松年教授为您讲授基因组学基础知识和前沿进展、基因转录组的测定及分析、基因芯片、二代测序等实验技术的关键事项;浙江大学杨军教授、陈铭教授等讲解系统生物学及高通量分析研究方法和思路。

  本研习班多次获得浙江大学优秀项目创新奖,目前已举办48期,学员来自全国30余个省市,累计培训学员4800余名。每次研习班不乏教授、博导参加,更受到博士后、硕博生等年轻学者的青睐。他们中有一些带着课题或问题前来交流和联系,不少学员通过本研习班建立了长期协作关系,共同申请国家973、863课题,共同发表论文,其中不少优秀的研究成果,已在SCI期刊上发表。

  一、培训班上课内容

  上课内容涵盖“基因组学—蛋白质组学—系统生物学”的研究方法、技术思路、前沿进展及其在各生物学科中的应用。

  核心课程包括:

  1. 基因组的比较研究、DNA测序技术原理与进展(讲课人:于军教授)

  2. 转录组的测定与分析、大规模测序方法及应用、微生物基因组学(讲课人:胡松年教授)

  3. 系统生物学建模分析及高通量分析技术应用(讲课人:杨军、陈铭教授等)

  4. 蛋白质组学概论及应用 (讲课人:钟伯雄教授)

  二、培训班上机内容

  上机实习课采用“跟我学”方式,学习实践各类基础生物信息学软件,每人一台PC机跟着大屏幕一步步学会基因组、蛋白质组学数据分析的基本方法。

  主要内容如下:

  实习一:基因组数据注释和功能分析

  通过序列比对工具BLAST的学习,了解基因功能注释的原理;介绍多序列联配工具ClustalX及分子进化分析软件MEGA4,掌握系统发生树绘制的基本方法,认识基因复制在进化上的功能;学习基因序列分析常用的数据库和软件。

  实习二:转录组数据分析

  介绍转录组数据分析的基本流程及其原理;通过对tophat、cufflinks、R等转录组数据分析工具的介绍及演示,了解基于二代测序数据的转录组分析流程及常用分析方法;利用kegg、GOstat、DAVID等在线工具挖掘转录组数据的生物学意义。

  实习三:芯片的基本数据处理和分析

  使用TM4软件来实现芯片的数据采集,低质量过滤,标准化处理及聚类等可视化分析;使用GenMAPP软件挖掘芯片数据在代谢途径中的生物学意义;介绍NCBI GEO数据库,学习检索和提交芯片数据。

  实习四:蛋白质结构与功能分析

  从数据库搜索感兴趣的蛋白质氨基酸序列开始,接着对蛋白质基本理化性质、二级结构、和三维空间结构和序列模体进行分析,预测目标蛋白的生物功能。

  实习五:蛋白质组质谱分析

  使用X!Tandem、Mascot、Sequest等软件鉴定蛋白质质谱数据,将质谱结果匹配到蛋白质组数据库鉴定蛋白;使用TPP软件包进行统计学分析和优化检索结果练习。

  实习六:系统生物学软件实习-----网络结构显示与分析

  利用Cytoscape系统生物学分析软件,分析蛋白-蛋白相互作用,展示分子网络系统,并与基因表达等数据整合。

  三、培训对象

  1.无生物信息学背景,希望了解生物信息学的学员;

  2.计划开展各类组学研究的科研人员;

  3.已有组学数据需了解分析方法的研究人员;

  4.有志从事生物信息学相关工作的学生或者技术人员。

  四、报名方法

  若有参加意向,请直接将回执发至genetrain@zju.edu.cn <mailto:genetrain@zju.edu.cn>,我们会即刻回函并在浙江大学继续教育系统录入,待排定课表后发给您详细课程表。待您再次确认后,发给您报到通知并排定上机号。培训结束,发放浙江大学继续教育证书。(尚有少量名额,请尽快报名)

  五、教材

  “DNA和蛋白质序列数据分析工具”(第三版),薛庆中等编著,科学出版社出版 2012年6月发行。

  ”基因组学概论”(第二版),薛庆中等编著,科学出版社出版 2016年1月发行。

  会务组提供。

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  六、其他事项

  收费标准:注册费为¥3800/人(现金、刷卡(包括公务卡)或转账)。

  食宿可统一安排,费用自理。

  联系人:代成林  沈志成

  联系电话:18757558672   13958194424

  咨询电话:0571-88206579

  电子邮件地址:daichenglin@zju.edu.cn;genetrain@zju.edu.cn <mailto:genetrain@zju.edu.cn>


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乘车路线 浙江大学华家池校区

    杭州火车站至浙江大学

    公交线路:21路

    1.从火车站乘坐21路至南肖埠小区站下车

    2.步行420米,到达浙江大学


    杭州萧山机场至浙江大学

    公交线路:机场巴士平海路线→35路

    1.从机场乘坐机场巴士平海路线至平海路站下车

    2.步行220乘坐35路至凤起东路秋涛北路站下车

    3.步行220米,到达浙江大学


公交/驾车去这里

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